Las áreas naturales protegidas de Honduras se crearon para asegurar la preservación de los ambientes naturales y sus componentes. Son áreas de regular extensión con características sobresalientes: ecosistemas, especies de flora y fauna, recursos naturales, históricos y culturales, y bellezas escénicas entre otras. Las áreas protegidas (AP) constituyen una importante estrategia para la conservación a largo plazo de la diversidad biológica y cultural, proporcionando bienes y servicios ecosistémicos esenciales para la sociedad y la vida en general.

La sierra del Merendón, es una cordillera situada en la frontera oriental de Guatemala y Honduras, tiene una gran diversidad de biomas y hábitats, incluyendo bosques nubosos, este territorio es de  gran importancia por su función en el equilibrio de la ecología, proporciona diversos servicios ambientales a la sociedad, como ser la producción de oxígeno, favorecer la calidad del agua, mantener los suelos fértiles, sirve de hábitats para diversos animales, y proporciona diferentes recursos como madera y materias primas para fabricar medicamentos, entre otros.

Este territorio ha enfrentado en las últimas décadas un fuerte deterioro, ocasionado por diversos factores como la deforestación, las presiones económicas y el crecimiento de la población que están intensificando el uso de la tierra, para su uso en actividades agrícolas, ganaderas y la tala ilegal.  Para aportar a la solución a esta problemática se desarrolla el Programa de Biodiversidad, Enlazando el Paisaje Centroamericano, que busca fortalecer la conectividad de los ecosistemas terrestres y marino-costeros dentro de cinco paisajes de la región que conectan a siete países de Centroamérica.

En la sierra del Merendón y en la alianza con La Fundación Para el Desarrollo Empresarial Rural (FUNDER),  en alianza con la Unión Internacional de Conservación para la Naturaleza, UICN, con apoyo financiero del Banco alemán KFW, en  las comunidades y co-manejadores de las áreas protegidas RVS Cuyamel, PN Omoa y PN Cusuco, se han realizado esfuerzos para la implementado mecanismos que han permitido a la restauración de 340 hectáreas de tierra, que antes eran utilizadas para el cultivo de granos básicos y ganadería tradicional, pero que ahora han sido restaurados con Sistemas Silvopastoriles y Sistemas Agroforestales (SAF) con cacao, rambután y otros frutales como naranja, limón, aguacate, incorporando albores forestales como caoba, cedro, laurel, Inga edulis, Gliricidia sepium. 

Los Sistemas Agroforestales (SAF) que son una serie de sistemas y tecnologías para el uso de la tierra en las que se combinan árboles con cultivos agrícolas y/o pastos, en función del tiempo y el espacio para incrementar y optimizar la producción en forma sostenible, por lo cual los SAF se convierten en una herramienta que permite restaurar áreas degradas, y establecer un sistema de producción como un medio de vida sostenible, generación de empleo, mejoramiento en la calidad de vida y disminución de la migración a las ciudades.